Научный семинар "Исследование медико-биологических данных"

Магистратура 2021/2022

Лучший по критерию «Новизна полученных знаний»

Статус: Курс обязательный (Анализ данных в биологии и медицине)

Направление: 01.04.02. Прикладная математика и информатика

Кто читает: Кафедра технологий моделирования сложных систем

Где читается: Факультет компьютерных наук

Когда читается: 1-й курс, 1-4 модуль

Формат изучения: без онлайн-курса

Охват аудитории: для своего кампуса

Преподаватели: Власов Василий Викторович, Кертес-Фаркаш Аттила, Рубинов Анатолий Рувимович

Прогр. обучения: Анализ данных в биологии и медицине

Язык: русский

Кредиты: 6

Контактные часы: 88

Полная версия программы учебной дисциплины

Аннотация

Настоящая дисциплина относится к блоку обязательных дисциплин. Изучение данной дисциплины базируется на следующих дисциплинах: Научно-исследовательский семинар «Исследование медико-биологических данных», 1 курс -«Молекулярная эволюция» Для освоения учебной дисциплины студенты должны владеть следующими знаниями: - Основные понятия эволюционной биологии - Основы эволюционной медицины

Цель освоения дисциплины

Познакомить с основными понятиями, используемыми в вычислительной филогентке

Планируемые результаты обучения

Владение основными программами для реконструкции филогенетических деревьев
Научить практически выполнять простейший филогенетический анализ семейства биологических последовательностейт.
Познакомить с основными алгоритмами вычислительной филогенетики
Познакомить с основными понятиями, используемыми в вычислительной филогентке
Познакомить с публикациями по данной тематике
Понимание русской и английской терминологии, относящейся к теме семинара, способность читать и понимать литературу по теме;
Понимание теоретических принципов вычислительной филогенетики

Содержание учебной дисциплины

Основные принципы молекулярной эволюции
Филогенетическое дерево как комбинаторный объект
Алгоритмы реконструкции филогенетических деревьев
Программы работы с филогенетическими деревьями. Форматы файлов
Современная литература по вычислительной филогенетике
Разбор статей и доклады студентов

Элементы контроля

Контрольная работа 1
Доклад по статье/практическому заданию
Контрольная работа 2
Экзамен

Промежуточная аттестация

2021/2022 учебный год 4 модуль
0.2 * Экзамен + 0.25 * Контрольная работа 2 + 0.3 * Доклад по статье/практическому заданию + 0.25 * Контрольная работа 1

Программа дисциплины