Исследование пространственной структуры фрактальной полимерной глобулы методами теории сложных сетей

В последнее время широкое развитие получили экспериментальные методы, позволяющие получить информацию о колокализации (пространственной близости) фрагментов ДНК в геноме живых клеток. В связи с этим представляется важным развитие методов анализа данных, позволяющих получить максимальный объем информации о пространственной организации генома по таким экспериментальным данным. В настоящей работе разработаны новые методы выделения сообществ (кластеров) близкорасположенных звеньев полимерной цепи по данным колокализации (такие сообщества известны в геномике под именем топологических доменов). Показано, что традиционные методы выделения сообществ на основе анализа спектров матриц колокализации не дают удовлетворительных результатов. С другой стороны, модифицированный метод выделения сообществ на основе максимизации функции модулярности позволяет получать осмысленное разбиение цепи на кластеры, а в некоторых случаях и выявить скрытую иерархическую структуру топологических доменов