Структурно-функциональные зависимости в альфа-гарпининах

ВКР посвящена предсказанию структуры пептида Tk-hefu2 (относящегося к семейству $\alpha$-гарпининов), не полученной в настоящее время экспериментально, и изучению возможностей метода молекулярной динамики (МД) для такого типа белков. В результате работы неизвестная структура Tk-hefu2 была предсказана методом МД. В процессе работы было показано, что метод МД не всегда выявляет важный конформационный переход в этой молекуле. Было установлено несколько возможных состояний Tk-hefu2, описаны структурно-динамические параметры, характерные для каждого состояния. Используя метод белковой топографии, был проведен анализ того, насколько каждая из полученных моделей соответствует функционально активному состоянию, блокирующему пору потенциал-чувствительных калиевых каналов. На основе полученных результатов была предложена предполагаемая структура Tk-hefu2. Полученные результаты могут иметь приложение в дальнейшем изучении структурно-функциональных зависимостей $\alpha$-гарпининов. Сделанные выводы могут быть полезны для предсказания структур других молекул.