• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта
ФИО студента
Название работы
Руководитель
Факультет
Программа
Оценка
Год защиты
Розенвальд Михаль Борисовна
Prediction of 3D Сhromatin Structure with Machine Learning Methods
10
2018
In recent years, applications of Machine Learning have substantially increased. In

particular, the utilization of these methods in the field of molecular biology is especially

significant.

The development of technologies enables rapid generation of large amounts of

epigenetic data. The novel Hi-C technology provides an opportunity to obtain data on the

genome interactions that has unraveled many principles of chromosomal folding, including

the subdivision of the genome into Topologically Associating Domains (TADs). Several

studies have confirmed the correlation between the structure of chromatin and other

epigenetic features [4, 5, 7].

My research focuses on using Machine Learning methods to predict the

three-dimensional structure of chromatin using ChIP-seq epigenetic data on chromatin

markers. This paper considers linear ​models with three types of regularization and an

architecture of Recurrent Neural Networks. As a result, predictive models were trained

and evaluated, the best score of weighted MSE was performed by Neural Networks.

Informative epigenetic features were identified that leads to studying their biological

significance.
Текст работы (работа добавлена 21 мая 2018г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Расширенный поиск ВКР