Разработка пайлайна для анализа метагеномных данных для задачи фекалотрансплантации

ФИО студента: Федоров Дмитрий Евгеньевич

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Анализ данных в биологии и медицине (Магистратура)

Год защиты: 2018

ТФМ (Трансплантация фекальной микробиоты) - многообещающий метод лечения различных патологий кишечника. При этом, в настоящее время, механизм действия этого метода остается не выясненным. Основным методом исследования механизмов ТФМ является анализ изменений микробиоты пациентов: 16S rRNA или полногеномное секвенирование (WGS) кала. Метагеномные данные (как и прочие -омиксные данные), всевозможные клинические данные о пациентах и донорах образуют массив больших данных, нуждающийся в программной среде для эффективного сбора и последующий обработки. В данной работе разработан прототип системы для анализа данных полногеномного секвенирования интегрированной с системой сбора и хранения клинической информации, система была апробирована путем проведения первичной обработки данных текущего исследования механизмов ТФМ в ФНКЦ ФХМ.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ