Автоматическое извлечение молекулярных параметров пациента из критериев включения в клинические испытания

ФИО студента: Тихонова Екатерина Александровна

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Анализ данных в биологии и медицине (Магистратура)

Год защиты: 2019

Критерии включения представлены в описаниях клинических испытаний в виде неструктурированного текста. В связи с этим при направлении пациента на клиническое испытание доктору необходимо вручную просматривать описания на предмет соответствия пациента критериям отбора. Частичная автоматизация этого процесса существенно сократила бы затраты времени специалистов. Ключевым этапом такой автоматизации является автоматическое извлечение информации о критериях отбора из текстов описаний клинических испытаний. Критериями отбора часто являются молекулярные параметры заболевания: генные и хромосомные мутации и изменения уровня экспрессии конкретных генов. В рамках данной выпускной квалификационной работы реализован алгоритм, который позволяет извлекать из текста информацию о молекулярных параметрах заболевания и представлять её в структурированном виде, удобном для дальнейшего использования в системах поиска, фильтрации и ранжирования клинических испытаний в соответствии с характеристиками конкретного пациента.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ