Глубинные нейронные сети для предсказания функциональных элементов генома

ФИО студента: Бекназаров Назар Сохибжонович

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Прикладная математика и информатика (Бакалавриат)

Оценка: 9

Год защиты: 2019

Участки левозакрученнои Z-ДНК обнаружены в геномах различных видов. Существуют экспериментальные данные о том, что Z- ДНК игра- ет роль в транскрипции, ремоделировании хроматина и рекомбинации. Связь эпигенетических факторов с Z-ДНК-саитами остается малоизу- ченнои. Целью даннои работы является предсказание саитов Z-ДНК в геноме человека, связанных с эпигенетическими маркерами, c помощью моделеи машинного обучения (ML). В частности, исследуется эффек- тивность сверточных, полносвязных и рекуррентных неиронных сетеи (CNN, FC и RNN) по сравнению с базовыми моделями машинного обу- чения. Было показано, что сверточные сети улучшают эффективность предсказания, а добавление рекурретных сетей к сверточным еще бо- лее значимо поднимает производительность модели. Результаты пока- зывают перспективность применения методов глубинного обучения к биоинформатическим задачам.

Текст работы (работа добавлена 19 мая 2019 г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ