• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта
ФИО студента
Название работы
Руководитель
Факультет
Программа
Оценка
Год защиты
Латышев Павел Васильевич
Аннотация генома функциональными элементами методами обучения с учителем
2019
Данная работа посвящена применению методов машинного обучения для распознавания G-квадруплексов. Исследования показывают, что G-квадруплексы играют важную роль в регуляции экспрессии генов, а также могут влиять на развитие тяжелых заболеваний, поэтому задача их распознавания является актуальной. В данной работе описано построение двух нейросетевых моделей, предсказывающих формирование G-квадруплексов. Первая модель использует сверточную нейронную сеть для предсказания наличия G-квадруплекса во фрагменте ДНК фиксированной длины 500 нуклеотидов. Вторая модель, с более сложной архитектурой, использующая двунаправленный LTSM-блок и сверточные слои, уточняет границы внутри фрагмента, внутри которого первая сеть детектировала присутствие G-квадруплекса. Такая двухуровневая модель позволяет эффективно аннотировать длинные ДНК последовательности. В результате удалось построить модель, значительно превосходящую в точности существующие методы, основанные на поиске паттернов.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Расширенный поиск ВКР