• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

ФИО студента
Название работы
Руководитель
Факультет
Программа
Оценка
Год защиты
Свидерская Карина Сергеевна
Структурно-динамическая модель комплекса укороченного аналога лантибиотика низин с его мишенью - фрагментом липида II
8
2019
Целенаправленно заблокировав работу молекулы липида II, участвующей в процессе обновления клеточной стенки, можно нарушить её синтез, лишив бактерию шансов на выживание. Наиболее перспективным кандидатом для разработки новых лекарств, действующим на липид II, является лантибиотик низин. С помощью ЯМР спектроскопии для него установлен мотив связывания с мишенью в растворе ДМСО, тогда как в реальных условиях, т.е. на поверхности бактериальной мембраны, структура комплекса остается неизвестной. Исследование системы низин/липид II с помощью методов компьютерного моделирования - важный шаг на пути понимания механизма взаимодействия молекул. В данной работе с помощью метода молекулярной динамики найдена конформация лантибиотика, при которой происходит наиболее эффективное взаимодействие низина с липидом II, сопоставимое с найденным в ЯМР экспериментах по числу образованных межмолекулярных водородных связей. Определены и описаны параметры, характеризующие такую структуру. Показано, что наличие молекул мишени в растворе стабилизирует эту конформацию. Выявлена зависимость структуры комплекса от окружения.
Текст работы (работа добавлена 19 мая 2019г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Расширенный поиск ВКР