• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта
ФИО студента
Название работы
Руководитель
Факультет
Программа
Оценка
Год защиты
Трофимов Юрий Алексеевич
Особенности динамического поведения молекул воды в ионном канале TRPV1
10
2019
Ионный канал TRPV1 это белок, участвующий в работе сенсорных систем клетки и обеспечивающий проведение через клеточную мембрану ионов и молекул воды в ответ на разнообразные физические и химические стимулы. Изучение динамики воды внутри поры канала может помочь в понимании механизмов функционирования TRPV1.

В работе проанализированы результаты молекулярно-динамического (МД) моделирования канала TRPV1 в открытом состоянии, помещенного в гидратированный липидный бислой. Показано, что пространственное распределение молекул воды в окрестности т.н. “нижних ворот” канала имеет крайне неоднородный характер: вблизи полярных групп белка присутствуют компактные области локализации воды, обусловленные действием двух факторов: формированием водородных связей белок-вода и т.н. эффектом исключенного объема. Время оседлости воды в таких областях в 2 – 5 раз превышает время оседлости около аналогичных полярных групп на поверхности белка. Формирование областей локализации в окрестности полярных групп аминокислотных остатков Asn676 может играть особую роль в функциональной активности белка: обеспечивая гидратацию “створа” нижних ворот, образуемого гидрофобными остатками Ile679. Благодаря сохранению подвижности своих боковых цепей, остатки Asn676 могут увеличивать или уменьшать уровень гидратации нижних ворот, управляя, таким образом, проводимостью канала.
Текст работы (работа добавлена 19 мая 2019г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Расширенный поиск ВКР