• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта
Версия для слабовидящихЛичный кабинет сотрудника ВШЭПоискМеню

Сравнительный анализ методов глубинного обучения для задач распознавания функциональных элементов генома

ФИО студента: Воронкова Анастасия Михайловна

Руководитель: Попцова Мария Сергеевна

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Программная инженерия (Бакалавриат)

Год защиты: 2020

G-квадруплексы - участки с неканонической формой ДНК. На данный момент до конца не известны их функции в геноме, но известно, что они могут быть связаны с различными заболеваниями, в первую очередь онкологическими и неврологическими. Поэтому изучение квадруплексов может быть очень полезно для создания лекарств. Целью данной работы является изучение нейросетевых методов распознавания G-квадруплексов в ДНК. В частности рассматривается применение сверточных и рекуррентных нейронных сетей в качестве базового подхода к задаче, а также недавно появившейся архитектуре нейросетей - трансформеров. Было показано, что они могут выучить сложные зависимости и вернуть хорошие результаты не только на текстах, но и на нуклеотидных последовательностях. Работа содержит 29 страниц, 4 главы, 11 рисунков, 1 таблица, 24 источника, 1 приложение. Ключевые слова: G-квадруплексы, машинное обучение, нейронные сети, ДНК, трансформеры.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ