Применение архитектуры Transformer для распознавания вторичных структур ДНК

ФИО студента: Ничвидюк Дарья Викторовна

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Прикладная математика и информатика (Бакалавриат)

Год защиты: 2021

Вторичная структура ДНК – это форма взаимодействия между нуклеотидами первичной структуре ДНК. Данная работа представляет собой исследование применения различных моделей архитектуры Transformer, обученных на корпусах естественных языков, а также нуклеотидных цепочках, для решения задачи распознавания вторичной структуры ДНК, а именно левозакрученной спирали Z-ДНК в геноме организма Mus musculus (Мышь Домовая) в сборке mm10. Были изучены применения моделей BERT, distilBERT, RoBERTa, XML-RoBERTa, CamemBERT и ESM-1. Работа нацелена на изучение и сравнение применения методов, которые призваны, не теряя точности распознавания, увеличивать скорость предсказания.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ