• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Распознавание триплексов с помощью омиксных данных методами глубинного обучения

ФИО студента: Фоменко Мария Михайловна

Руководитель: Попцова Мария Сергеевна

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Анализ данных в биологии и медицине (Магистратура)

Год защиты: 2021

В клеточном ядре транскрибируется большое число длинных некодирующих РНК, как минимум часть из которых выполняет разнообразные функции. Один из способов взаимодействия таких РНК с другими соединениями — формирование РНК-ДНК-ДНК триплекса в результате связывания с двойной цепочкой ДНК. В моей работе разработана модель глубинного обучения, которая на основе последовательности ДНК и омиксных данных предсказывает сайты формирования триплексных структур в человеческом геноме. Также проведена интерпретация результатов работы модели: выделены и проанализированы признаки, дающие стабильно высокий вклад в предсказание. Некоторые из таких признаков позволяют сделать предположения о возможных малоизученных функциях триплексов.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ