Предсказание возрастной регуляции альтернативного сплайсинга кассетных экзонов по последовательности окружающих интронов в генах мыши.

В данной работе проводится обзор механизма, функций и значимости сплайсинга, а также обзор методов и моделей машинного обучения. Исследована практика применения методов машинного обучения к задаче предсказания альтернативного сплайсинга в опубликованной литературе. Проведена серия экспериментов по классификации экзонов домовой мыши с постоянным, растущим или убывающим с возрастом включением на основе последовательностей окружающих интронов и аффинностей известных РНК-связывающихся белков к этим последовательностям. Использованы классификаторы: случайные леса, многослойные перцептроны, логистическая регрессия. Качество тренированных классификаторов проверено методом кросс-валидации. Проведён анализ значимости использованных признаков и сравнение признаков, значимых для классификации динамики включения экзонов в шести тканях. Результаты экспериментов подтверждают применимость машинного обучения к задачам предсказания сплайсинга на примере поставленной в данной работе задаче предсказания возрасто-зависимого сплайсинга.