Действие дрейфа и отбора на преждевременные старт-кодоны в геномах млекопитающих

ФИО студента: Сегодин Виталий Валерьевич

Руководитель: Денисов Степан Владимирович

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Анализ данных в биологии и медицине (Магистратура)

Год защиты: 2018

Данная работа посвящена влиянию отбора на короткие рамки считывания (sORF), находящиеся в 5’ лидерной области (5’UTR) перед основной рамкой трансляции (CDS) белок-кодирующих генов. Анализ проводился на филогенетическом дереве приматов среди отобранных генов для трех типов коротких рамок: uORF (upstream open reading frame), iORF (in-frame open reading frame) и oORF (overlapping reading frame). В результате проделанной работы выяснилось, что появление преждевременных старт кодонов в 5’UTR области ограничено из-за воздействия отрицательного отбора, а iORF конфигурация старт кодона является наиболее вредной. В то же время зафиксировавшиеcя в популяции uORF и oORF поддерживаются стабилизирующим отбором, однако iORF вымываются из популяции положительным отбором. Также было проанализировано влияние таких признаков, как длина рамки, близость к основной рамке считывания (для uORF), длина N-концевого удлинения (для iORF) и сила контекста старт-кодона (для всех трех типов коротких рамок) на силу отбора.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ