Сравнение случайных деревьев и иерархическая доменная структура хроматина

ФИО студента: Чхеидзе Агата Андреевна

Руководитель: Тамм Михаил Владимирович

Кампус/факультет: Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова

Программа: Математические методы моделирования и компьютерные технологии (Магистратура)

Оценка: 8

Год защиты: 2019

В настоящей работе объектом исследования являются графы - иерархические деревья, описывающие доменную структуру Hi-C карт хроматина. Целью работы является разработка алгоритма количественного сравнения таких иерархических деревьев. В работе предложена количественная мера близости двух иерархических деревьев («расстояние»), разработан алгоритм для ее вычисления, реализованный в консольном приложении на языке программирования C++. Проведен подробный статистический анализ предложенной меры близости для случайных деревьев различных размеров, коррелированных деревьев и деревьев, полученных друг из друга заданным числом малых элементарных возмущений. Проведен анализ зависимости расстояний и их распределений от параметров задачи, выдвинут ряд гипотез о скейлинговом поведении соответствующих зависимостей. Результаты, полученные в данной работе, могут служить основой для сравнения иерархических деревьев, получаемых пои анализе экспериментальных Hi-C карт.

Текст работы (работа добавлена 19 мая 2019 г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ