Применение методов машинного обучения для предсказания пространственной структуры белков

ФИО студента: Чистяков Глеб Игоревич

Руководитель: Посыпкин Михаил Анатольевич

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Прикладная математика и информатика (Бакалавриат)

Оценка: 8

Год защиты: 2020

Предсказание трехмерной структуры белка является одной из важнейших задач в биоинформатике. Оно способствует пониманию взаимодействия нескольких белков, в результате чего становится возможным изобретение новых лекарственных средств. С развитием глубинного обучения моделирование процесса сворачивания белка (фолдинга) вышло на новый уровень, так как экспериментальные методы требуют много времени и финансов. В данной работе описываются способы предсказания класса двугранных углов α крупноблочной модели белка, которые впоследствии можно использовать в качестве начального приближения для построения 3D структуры аминокислотной последовательности. Для бинарной классификации удалось добиться показателя F-меры 0.88, для трехклассовой – 0.79, для четырехклассовой – 0.75.

Текст работы (работа добавлена 19 мая 2020 г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ