• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Регуляция Альтернативного сплайсинга у Polypedilum vanderplanki в течении цикла дегидратации-регидратации

ФИО студента: Тагмазян Арина Андраниковна

Руководитель: Мазин Павел Владимирович

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Анализ данных в биологии и медицине (Магистратура)

Оценка: 9

Год защиты: 2020

Ангидробиоз является стрессовой ситуацией для любого живого организма. Однако личинки Polypedilum vanderplanki смогли адаптироваться и выживать в условиях обезвоживания. Понимание процесса дегидратации и адаптации к нему на молекулярном уровне в будущем может быть использовано в таких областях как сельское хозяйство и медицина. Целью данного исследования было изучить изменения альтернативного сплайсинга в цикле дегидратации-регидратации и их роль в устойчивости к высыханию у Polypedilum vanderplanki. Мы анализировали альтернативный сплайсинг в данных РНК-секвенирования личинок P. vanderplanki на разных стадиях ангидробиоза. Было найдено 1322 альтернативных сегментов в 717 генах значимо меняющих свое включение в ходе цикла дегидратации-регидратации. Более того, кассетным экзонам, исключенным при высыхании, свойственно наличие более длинных (> 100 нт.) фланкирующих интронов значимо чаще чем константным и альтернативным, но не дифференциально сплайсируемым, группам сегментов. Используя анализ регуляторных элементов совместно с анализом дифференциальной экспрессии мы обнаружили 9 мотивов, связанных с девятью РНК-связывающими белками спящей хирономиды, потенциально участвующие в пропуске кассетных экзонов во время дегидратации. Ключевые слова: Polypedilum vanderplanki; альтернативный сплайсинг; РНК- связывающие белки; ангидробиоз; РНК-секвенирование

Текст работы (работа добавлена 22 мая 2020 г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ