Регуляция альтернативного сплайсинга в ходе развития органов мыши

Данная работа посвящена исследованию роли альтернативного сплайсинга (АС) в развитии организма мыши, а также поиску потенциальных регуляторов АС, ответственных за ткань-специфичное возрастное изменение сплайсинга. Исследование позволило сделать вывод, что у определенных пар тканей, как например кора мозга-мозжечок и печень-почки, чаще других происходят изменения сплайсинга одних и тех же экзонов, а также наблюдается более высокая согласованность направлений изменения сплайсинга. При этом некоторые пары тканей синхронно меняют сплайсинг только в одном направлении, например, у одних и тех же экзонов частота включения растет в ходе развития в обоих тканях, в то время как для падения частоты включения такой согласованности не наблюдается. Печень и почки имеют самую выраженную тенденцию синхронно понижать частоту включения кассетных экзонов в процессе развития организма. GO enrichment анализ показал, что гены, содержащие такие экзоны, помимо общей биологической роли в развитии двух тканей чаще чем можно ожидать случайно отвечают за регуляцию АС. Были проанализированы гены, кодирующие белки, содержащие РНК-связывающие мотивы. Они чаще других генов меняют экспрессию с возрастом, что подтверждает их роль в развитии организма. Экзоны, рядом с которыми находятся мотивы, распознаваемые такими белками, больше меняют АС. При этом определенные мотивы регулируют АС в множестве белков, важных для эмбрионального развития.