• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта
Версия для слабовидящихЛичный кабинет сотрудника ВШЭПоискМеню

Роль открытых рамок считывания в 5'-нетранслируемой области в регуляции экспрессии по нонсенс-опосредованному распаду

ФИО студента: Мазаев Лев Сергеевич

Руководитель: Денисов Степан Владимирович

Кампус/факультет: Факультет компьютерных наук

Программа: Анализ данных в биологии и медицине (Магистратура)

Год защиты: 2020

Многие мРНК эукариот несут альтернативные открытые рамки считывания (uORFs) в 5’-нетранслируемой области в дополнение к основной белок-кодирующей рамке (ORF). uORF выступают в качестве цис-регуляторных элементов в пост-транскрипционной регуляции экспрессии генов. Они препятствуют трансляции основной рамки, а также могут вызывать нонсенс-опосредованный распад мРНК (NMD), изменяя тем самым экспрессию гена. Цель этой работы - установить масштаб влияния uORF на деградацию мРНК, используя данные РНК-секвенирования в клеточной линии человека HEK293 с деплецией основных факторов NMD. Нам удалось показать, что гены с uORF активно реагируют на инактивацию системы NMD, повышая свою экспрессию сильнее, чем прочие гены. Также, при подавлении NMD в некоторых генах, имеющих изоформы мРНК как содержащие, так и не содержащие uORF, наблюдается значительный рост доли транскриптов с uORF. Это означает, что включение uORF-содержащего экзона в мРНК в ходе сплайсинга может носить авторегуляторный характер, как это установлено для петель обратной связи в NMD-опосредованном альтернативном сплайсинге.

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ