• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Уточнение предсказания формы антител с помощью глубокого обучения

ФИО студента: Соликов Павел Дмитриевич

Руководитель: Москвин Денис Николаевич

Кампус/факультет: Санкт-Петербургская школа физико-математических и компьютерных наук

Программа: Прикладная математика и информатика (Бакалавриат)

Оценка: 9

Год защиты: 2020

Предсказание трехмерной структуры участка антитела, петли H3, по последовательности является важной нерешенной задачей биоинформатики. Существующие методы решения редко могут выдать качественное предсказание и в среднем их точность оказывается чрезвычайно низкой. Также их проблема заключается в том, что они не используют методы глубокого обучения, являющиеся на данный момент стандартным способом решения в таких областях как компьютерное зрение, обработка естественного языка и так далее. В данной работе был предложен способ предсказания структуры петли H3 используя только глубокое обучение. Было рассмотрено несколько способов кодирования аминокислотных последовательностей, наделяющие их структурной и семантической информацией, а также позволяющие преодолеть малое количество данных. Наконец, было применено несколько различных архитектур глубоких нейронных сетей, которые продемонстрировали высокие результаты в области обработки естественного языка. Лучшая полученная модель была протестирована на заранее не известном наборе данных и показала результат, сравнимый по точности с существующими решениями.

Текст работы (работа добавлена 28 мая 2020 г.)

Выпускные квалификационные работы (ВКР) в НИУ ВШЭ выполняют все студенты в соответствии с университетским Положением и Правилами, определенными каждой образовательной программой.

Аннотации всех ВКР в обязательном порядке публикуются в свободном доступе на корпоративном портале НИУ ВШЭ.

Полный текст ВКР размещается в свободном доступе на портале НИУ ВШЭ только при наличии согласия студента – автора (правообладателя) работы либо, в случае выполнения работы коллективом студентов, при наличии согласия всех соавторов (правообладателей) работы. ВКР после размещения на портале НИУ ВШЭ приобретает статус электронной публикации.

ВКР являются объектами авторских прав, на их использование распространяются ограничения, предусмотренные законодательством Российской Федерации об интеллектуальной собственности.

В случае использования ВКР, в том числе путем цитирования, указание имени автора и источника заимствования обязательно.

Реестр дипломов НИУ ВШЭ