• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Исследование возможности использования синонимичных замен в гене для повышения уровня экспрессии рекомбинантных белков в Escherichia coliStudy of the possibility of using synonymous substitutions in genes to increase the expression level of recombinant proteins in Escherichia coli

Соискатель:
Заболотский Артур Игоревич
Руководитель:
Катруха Алексей Генрихович (др. работы под рук-вом)
Члены комитета:
Степанова Евгения Владиславовна (НИУ ВШЭ, д.м.н., председатель комитета), Лунин Владимир Глебович (НИЦЭМ им. Н. Ф. Гамалеи, д.б.н., член комитета), Можаев Андрей Александрович (ГНЦ ИБХ РАН, к.х.н., член комитета), Тоневицкий Александр Григорьевич (НИУ ВШЭ, д.б.н., член комитета), Федоров Алексей Николаевич (ФИЦ Биотехнологии РАН, д.б.н., член комитета)
Диссертация принята к предварительному рассмотрению:
12/23/2025
Диссертация принята к защите:
3/5/2026
Дисс. совет:
Cовет по биологии
Дата защиты:
6/25/2026
Выбор между синонимичными кодонами на N-конце генов оказывает значительное влияние на экспрессию белков в Escherichia coli. Это объясняется разным вкладом синонимичных кодонов в формирование вторичной структуры мРНК в регионе инициации трансляции. Вторичные структуры на 5'-конце мРНК препятствуют связыванию рибосом с последовательностью Шайна-Дальгарно и негативно влияют на процесс инициации трансляции. Данная диссертация посвящена разработке подхода оптимизации уровня экспрессии гетерологичных генов в рекомбинантной системе Escherichia coli, основанный на скрининге частично рандомизированной библиотеки конструкций с синонимичными заменами в 5’-конце кодирующей последовательности мРНК.
Диссертация [*.pdf, 5.07 Мб] (дата размещения 4/3/2026)
Резюме [*.pdf, 1.22 Мб] (дата размещения 4/3/2026)
Summary [*.pdf, 1.31 Мб] (дата размещения 4/3/2026)

Публикации, в которых излагаются основные результаты диссертации

Zamotina M.A., Muranova L.K., Zabolotskii A.I., Gusev N.B. Interaction of small heat shock proteins with BAG3 (смотреть на сайте журнала)
Katrukha I.A., Riabkova N.S., Kogan A.E., Vylegzhanina A.V., Mukharyamova K.S., Bogomolova A.P., Zabolotskii A.I., Koshkina E.V., Bereznikova A.V., Katrukha A.G. Fragmentation of human cardiac troponin T after acute myocardial infarction (смотреть на сайте журнала)
Zabolotskii A.I., Riabkova N.S. A new look at the fluorescent protein-based approach for identifying optimal coding sequence for recombinant protein expression in E.coli (смотреть на сайте журнала)
Zabolotskii A.I., Kozlovskiy S.V., Katrukha A.G. The Influence of the Nucleotide Composition of Genes and Gene Regulatory Elements on the Efficiency of Protein Expression in Escherichia coli (смотреть на сайте журнала)