2025/2026
Введение в эпигеномику
Язык:
русский
Кредиты:
5
Контактные часы:
76
Программа дисциплины
Аннотация
Дать практические навыки применения методов биоинформатики для анализа и интерпретации биологических данных по эпигеномике.
Планируемые результаты обучения
- Ознакомить с базовыми алгоритмами и форматами данных биоинформатики
- Формирование у студентов основных биоинформатических навыков и приобретение ими практического опыта, необходимого для проведения самостоятельных научных исследований в области физико-химической биологии.
- Умеет определять альфа-, бета- и гамма- разнообразие
- Умеет определить виды организмов представленных в метагеномном образце.
Содержание учебной дисциплины
- Введение в эпигеномику
- Метилирование ДНК
- Модификации гистонов
- Доступность ДНК
- ChromHMM
- Вторичные структуры ДНК
- Работа над проектом
- Метагеномика
- Защита проектов
Элементы контроля
- Домашнее задание
- Проект
- ЭкзаменЭкзамен сдают те, кто не получил автомат по результатам домашних заданий. Также его могут сдать студенты, желающие повысить свою оценку.
- Квизы
Промежуточная аттестация
- 2025/2026 4th moduleНакоп = Округление(0.3*ДЗ + 0.3*ПРОЕКТ + 0.1*КВИЗЫ + 0.3 Экзамен), где ПРОЕКТ = 0.7*Инд_часть + 0.3*Групповая_часть ДЗ - средняя за ДЗ КВИЗЫ - средняя за КВИЗЫ
Список литературы
Рекомендуемая основная литература
- Evolutionary Genomics ; Statistical and Computational Methods. (2019). Springer New York. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-9074-0
- Mushegian, A. R. (2007). Foundations of Comparative Genomics. Amsterdam: Academic Press. Retrieved from http://search.ebscohost.com/login.aspx?direct=true&site=eds-live&db=edsebk&AN=199143
Рекомендуемая дополнительная литература
- Pevsner, J. (2015). Bioinformatics and Functional Genomics (Vol. Third edition). Chichester, West Sussex, UK: Wiley-Blackwell. Retrieved from http://search.ebscohost.com/login.aspx?direct=true&site=eds-live&db=edsebk&AN=1055003