Бакалавриат
2026/2027





Научно-исследовательский семинар "Машинное обучение для решения биологических и биомедицинских задач"
Статус:
Курс обязательный (Когнитивная нейробиология)
Кто читает:
Базовая кафедра Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Где читается:
Факультет биологии и биотехнологии
Когда читается:
4-й курс, 1, 2 модуль
Охват аудитории:
для своего кампуса
Язык:
русский
Кредиты:
3
Контактные часы:
36
Программа дисциплины
Аннотация
НИС "Машинное обучение для решения биологических и биомедицинских задач" нацелен на изучение современных методов машинного обучения и их применения в биологии и медицине. Студенты ознакомятся с основными концепциями и алгоритмами машинного обучения, а также с их специфическими приложениями в различных областях биологических исследований.
Цель освоения дисциплины
- Целями освоения дисциплины являются: • сформировать у слушателей практических и систематических навыков анализа биомедицинских данных; • сформировать представления о применении современных технологий обработки биомедицинской информации; • познакомить слушателей с основными принципами и приёмами статистической обработки данных • научить слушателей основным понятиям и постановкам задач машинного обучения, возникающих в биологических и биомедицинских задачах; • дать теоретические основы ключевых методов машинного обучения; • познакомить с принципами построения композиций моделей машинного обучения; • познакомить с основными метриками качества для регрессии и классификации; • научить выполнять полный цикл построения модели; • научить обучать основные модели машинного обучения, оценивать их качество; • научить выполнять кластеризацию и визуализацию данных; • дать базовые знания об архитектурах искусственных нейронных сетей, базовых методах их обучения и оценки качества.
Планируемые результаты обучения
- Студент ориентируется в классификации задач компьютерного зрения (распознавание, сегментация, детекция); формулирует основные принципы построения сверточных нейросетевых архитектур (CNN) для их решения; создаёт, обучает и дообучает соответствующие модели для решения медицинских и биологических задач.
- Студент формулирует основные задачи NLP и их аналоги в биологии и медицине; владеет методами bag-of-words и TF-IDF для задач NLP и их аналогов; воспроизводит основные концепции и подходы в построении трансформерных моделей.
- Студент ориентируется в прикладных ИИ-моделях и задачах биологии, медицины и фармацевтики, соотносит поставленные задачи с инструментами их решения; формулирует основные подходы построения и применения агентных ИИ-моделей в биологии, медицине и фармацевтике.
Содержание учебной дисциплины
- Введение в задачи компьютерного зрения в биологии и медицине
- Трансформеры: основа архитектуры и применение в биоинформатике.
- Обзор ИИ-инструментов для биологии и медицины
Элементы контроля
- Итоговая контрольная работа
- Семинарская активность
- Домашние задания
- Экзаменационная работа
Промежуточная аттестация
- 2026/2027 2nd module0.025 * Семинарская активность + 0.7 * Итоговая контрольная работа + 0.2 * Экзаменационная работа + 0.025 * Домашние задания
Список литературы
Рекомендуемая основная литература
- Transformers for machine learning : a deep dive, Kamath, U., 2022
- Биологическое и компьютерное зрение, Крейман, Г., 2022
- Золкин, А. Л. Основы алгоритмизации, мировые информационные ресурсы, медико-биологическая статистика : учебное пособие / А. Л. Золкин. — Самара : , 2022 — Часть 1 — 2022. — 161 с. — ISBN 978-5-907359-09-3. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/326534 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.
- Компьютерное зрение : современный подход, Форсайт, Д., 2004
- Осваиваем архитектуру Transformer : разработка современных моделей с помощью передовых методов обработки естественного языка, Йылдырым, С., 2022
Рекомендуемая дополнительная литература
- Hastie, T., Tibshirani, R., & Friedman, J. H. (2009). The Elements of Statistical Learning : Data Mining, Inference, and Prediction (Vol. Second edition, corrected 7th printing). New York: Springer. Retrieved from http://search.ebscohost.com/login.aspx?direct=true&site=eds-live&db=edsebk&AN=277008