Магистратура
2026/2027
Введение в популяционную генетику и эволюция методов оценки племенной ценности
Статус:
Курс обязательный (Биоинформатика в агробиотехнологиях)
Кто читает:
Институт аграрных исследований
Где читается:
Научные подразделения
Когда читается:
1-й курс, 2 модуль
Охват аудитории:
для своего кампуса
Преподаватели:
Сермягин Александр Александрович
Язык:
русский
Кредиты:
3
Контактные часы:
40
Программа дисциплины
Аннотация
Эволюция методов оценки племенной ценности сельскохозяйственных животных. Современное состояние и система оценки генотипа особей в России. Методы ANOVA / MANOVA для определения изменчивости количественных признаков, силы влияния средовых и генетических факторов, включенных в модель. Наилучший линейный несмещенный прогноз (базовые принципы: BLUP Sire Model, Animal Model). Селекционный индекс как метода отбора животных по комплексу признаков. Конструирование селекционного индекса на примере молочного скотоводства: принципы и последовательность построения. Международная система генетической оценки быков – INTERBULL. Прикладные аспекты использования данных полногеномного SNP-генотипирования в решении задач животноводства. Особенности подготовки данных полногеномного SNP-генотипирования для анализа в зависимости от задач исследований. Оценка генетической структуры популяции и параметров генетического разнообразия в популяции (выборке) животных на основании данных полногеномного SNP-генотипирования. Анализ многомерного шкалирования (главных компонент) для оценки генетической вариабельности, оценка результатов адмиксии и ее практическое использование. Паттерны гомозиготности: анализ количества и длин фрагментов, оценка геномного инбридинга, оценка мультилокусной гетерозиготности. Принципы и методы структурной аннотации полиморфизмов (идентификация генов) у сельскохозяйственных животных. Полногеномные ассоциативные исследования (GWAS): теоретические и практические аспекты. Формирование списков генов для аннотации по результатам различных анализов (поиск локусов под давлением, GWAS). Геномная селекция животных: от фенотипа к генотипу. Референтная популяция: принципы формирования. Обработка генетической информации для использования в племенной работе (геномная оценка).
Цель освоения дисциплины
- Cформировать систему теоретических знаний и практических умений по генетике количественных признаков животных сельскохозяйственных видов, формулировать и решать поставленные задачи по повышению продуктивности особей на уровне стад и популяций с использованием современных методов оценки генотипа, осуществлять построение и расчет различных генетико-математических и статистических моделей на примере животноводства, описывающих изменчивость признаков продуктивности на уровне биологических механизмов регулирования.
Планируемые результаты обучения
- Иметь систему знаний о характеристике продуктивности различных видов сельскохозяйственных животных.
- Ориентироваться в понятиях и терминах из области зоотехнии и ветеринарии, описании продуктивных качеств животных.
- Знать методы оценки генотипа с/х животных с учетом информации по фенотипическим и генетическим особенностям.
- Выполнять популяционно-генетические исследования при решении прикладных задач животноводства.
- Планировать селекционные программы на основе реальных информационных данных и проводить моделирование отбора.
- Уметь составлять уравнения смешанных моделей с различными числом фиксированных, регрессионных и рандомизированных факторов.
- Ориентироваться в современных литературных источниках, ИИ и методах популяционной генетики с целью применения полученных знаний для решения практико-ориентированных задач.
- Владеть системой знаний о основных популяционно-генетических методах (изменчивость, наследуемость), используемых при оценке генотипа животных, конструирования экономического селекционного индекса, расчета племенной ценности особей по разному числу информационных источников.
- Владеть первичными навыками описательной статистики, работы с электронными базами данных, основами программирования и биоинформатики.
Содержание учебной дисциплины
- Раздел 1. Эволюция методов оценки племенной ценности сельскохозяйственных животных.
- Раздел 2. Зоотехнический и племенной учет на примере молочного скотоводства.
- Раздел 3. Методы определения изменчивости
- Раздел 4. Расчет племенной ценности
Промежуточная аттестация
- 2026/2027 2nd module0.2 * Проектная работа + 0.3 * Дискуссии на лекциях и семинарах. + 0.5 * Экзамен
