Ефремов Роман Гербертович

Oбразование, учёные степени и учёные звания

2007

Ученое звание: Профессор

2000

Доктор физико-математических наук

1986

Кандидат физико-математических наук

1983

Специалитет: Московский инженерно-физический институт, специальность «Дозиметрия и защита», квалификация «Инженер-физик»

Дополнительное образование / Повышение квалификации / Стажировки

2019 г. ФГАО "Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)" по дополнительной профессиональной программе "Информационно-комму-никационные технологии в образовательном процессе" в объеме 24 час.Удостоверение .

Профессиональные интересы

Вычислительная биология компьютерная биология молекулярное моделирование структура и динамика биомолекул биофизика

Достижения и поощрения

Участие в научных советах и обществах:
- член Ученого Совета ИБХ РАН;
- член трех специализированных диссертационных советов (ИБХ РАН, МГУ, ГУ НИИ БМХ РАМН);
- член Американского химического общества;
- член Биофизического общества (США).
Надбавка за публикацию в журнале из Списка А (и приравненном к нему научном издании) (2025–2026, 2024–2025, 2023–2024)
Надбавка за публикацию в международном рецензируемом научном издании (2022–2023, 2021–2022, 2019–2021)
Надбавка за статью в зарубежном рецензируемом журнале (2014–2016)
Надбавка за статью в зарубежном рецензируемом научном издании (2016–2018)

Учебные курсы (2025/2026 уч. год)

Компьютерная молекулярная биология и медицина (Маго-лего; где читается: Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова; 1, 2 модуль)рус
Компьютерная молекулярная биология и медицина (Магистратура; где читается: Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова направление: 01.04.04 Прикладная математика, 01.04.02 Прикладная математика и информатика; 1-й курс, 1, 2 модуль)рус
Математические методы и компьютерные технологии (семинар наставника) (Магистратура; где читается: Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова направление: 01.04.04 Прикладная математика, 01.04.02 Прикладная математика и информатика; 1-й курс, 1-4 модуль)рус
Архив учебных курсов

Выпускные квалификационные работы студентов

1. Магистерская диссертация: Лихоносова А.Ф. "Структурно-функциональные зависимости в альфа-гарпининах", 2014-2016 гг.

Расписание занятий на сегодня

Расписание занятий по физической культуре в спортивных секциях

Полное расписание

Публикации (2009-2013 гг.)

ЕфремовРГ_публикации 2009_2013.pdf

Публикационная активность

Опубликовано:

163 статьи в реферируемых изданиях;

1 монография;

3 учебных пособия

Индекс Хирша (по данным Web of Science): 28

Индекс цитирования (данные на июль 2016 г.): 2370

Участие в редколлегиях научных журналов

С 2019 г.: член редколлегии журнала «International Journal of Molecular Sciences».

С 2019 г.: член редколлегии журнала «Scientific Reports».

С 2013 г.: член редколлегии журнала «Biology Direct».

С 2009 г.: заместитель главного редактора журнала «Биологические мембраны».

С 2008 г.: член редколлегии журнала «Open Bioinformatics Journal».

С 2008 г.: член редколлегии журнала «Open Structural Biology Journal».

С 2007 г.: член редколлегии журнала «Биоорганическая химия».

Конференции

2016
Актуальные вопросы биологической физики и химии БФФХ-2016 (Севастополь). Доклад: Оценка влияния среды на димеризацию трансмембранных доменов гликофорина А в компьютерном эксперименте
Khujand Symposium on Computational Materials and Biological Sciences 2016 (Худжанд). Доклад: Helix-helix interactions in membranes: focus on lipids

2014
Dushanbe Symposium on Computational Materials and Biological Sciences DSCMBS-2014 (Душанбе). Доклад: The adaptable lipid matrix promotes transmembrane helices association in membranes

Гранты

Грант Российского научного фонда «Компьютерный анализ структурно-функциональных аспектов олигомеризации трансмембранных доменов рецепторов сигнальных систем клетки», 2014-2016 гг., руководитель.
Грант Российского научного фонда «Молекулярные технологии управления нейросигнализацией», 2014-2016 гг., отв. соисполнитель.
Грант Программы Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология», тема: «Молекулярное моделирование пептидов и белков в мембранах как фундаментальная основа для рационального конструирования новых биологически активных соединений», 2013-2017 гг., руководитель.
Грант Программы Президиума РАН № 27 «Основы фундаментальных исследований нанотехнологий и наноматериалов», тема: «Новые вычислительные технологии мультимасштабного моделирования мезоскопических биомембранных систем: от понимания фундаментальных принципов структурно-динамического поведения – к созданию наноструктур для биомедицинских приложений», 2012-2014 гг., руководитель.
Грант РФФИ «Коллективные молекулярные движения, кластеры и флуктуации в гидратированных липидных бислоях и их роль в структурно-динамическом поведении клеточных мембран», 2013-2015 гг., руководитель.
Грант РФФИ «Клеточные мембраны как стохастические динамические системы: от атомистического моделирования – к рациональному конструированию новых мембранных материалов», 2016-2018 гг., руководитель.

Руководитель исследовательской группы и научного семинара в области биомолекулярного моделирования

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) (www.ibch.ru)

Заместитель директора по научной работе;

Заведующий Лабораторией моделирования биомолекулярных систем (model.nmr.ru);

Руководитель научного семинара в области биомолекулярного моделирования (model.nmr.ru);

Руководитель научного семинара "Технологии суперкомпьютерного моделирования", НИУ ВШЭ, МИЭМ, Департамент прикладной математики (https://www.hse.ru/ma/mmat/super)

Опыт работы

Основное место работы:

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А.Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН)

Занимаемые должности (ИБХ РАН):

2008 - наст. время заместитель директора по науке

2007 - наст. время руководитель Лаборатории моделирования биомолекулярных систем

2001 - 2007 ведущий научный сотрудник

1990 - 2001 старший научный сотрудник

1986 - 1990 научный сотрудник

21

июль

2021

В ВШЭ открывается новая магистерская программа «Системный анализ и математические технологии»

Программа будет готовить специалистов в области разработки, исследования и применения методов математического моделирования и новейших компьютерных технологий для комплексного анализа сложных систем и больших данных. Студенты освоят современные методы аналитики - от построения математических моделей и алгоритмов до разработки эффективных вычислительных методов с применением технологий машинного обучения.

27

июль

2020

«Важная часть программы – самостоятельная исследовательская деятельность»

Программа «Математические методы моделирования и компьютерные технологии», реализуемая МИЭМ НИУ ВШЭ, направлена на подготовку специалистов высокого класса, способных вести исследования на стыке различных областей математики и ее приложений в актуальных и перспективных задачах моделирования. Выпускники магистратуры рассказали новостной службе о том, что определило их выбор после бакалавриата, программе в целом и планах на аспирантуру.

19

янв.

2017

Как суперкомпьютер создает лекарства

23

окт.

2014

Образован Академический совет магистерской программы

Состав академического совета образовательной программы магистратуры "Математические методы моделирования и компьютерные технологии"