Методы ускоренной селекции животных (биоинформатика)

2026/2027

ID 1108332

Статус: Майнор

Кто читает: Базовая кафедра ГК «ЭкоНива»

Где читается: Базовые кафедры

Охват аудитории: для всех кампусов НИУ ВШЭ

Преподаватели: Сермягин Александр Александрович, Черняева Екатерина Николаевна

Язык: русский

Кредиты: 5

Контактные часы: 78

Дополнительные материалы в LMS Задать вопрос

Аннотация

Учебная дисциплина является дополнительной к основному направлению обучения студента, она реализуется в рамках майнора «Цифровизация и искусственный интеллект в Агропромышленном комплексе», базируется на знании основ математики и информатики. Эффективное развитие животноводства невозможно без четко налаженной и интегрированной селекционно-племенной работы. В этих условиях в идеале каждое стадо коров должно пополняться особями лучшей породности с устойчивыми наследственными признаками. Селекционно-племенная работа также является движущей силой развития в АПК.

Цель освоения дисциплины

Формирование у студентов компетенций в области применения цифровых технологий, искусственного интеллекта и современных методов анализа данных для оптимизации селекционно-племенной работы в животноводстве, направленной на повышение продуктивности стад и устойчивости АПК.

Планируемые результаты обучения

- анализирует данные, полученные из различных программ
- работает с базами генетических и геномных данных
- анализирует работу по оптимизации и управлению селекционными проектами
знать роль селекционно-племенной работы в развитии животноводства, ее цели и задачи, а также экономическое значение. для АПК
знакомство с нейросетевыми моделями, их применение для анализа геномных данных (SNP-маркеров)
знать цифровые инструменты автоматизации процессов в АПК
 знать генетику количественных признаков: наследуемость, геномную селекцию, геномные технологии в животноводстве
проводит генетическое тестирование (SNP-маркеры, GWAS): вариации последовательности ДНК, методы обнаружения связи между конкретными SNP и продуктивными/репродуктивными признаками
 формулирует использование репродуктивных технологий: ЭКО, трансплантацию эмбрионов, криоконсервацию,
 проводить мониторинг продуктивности, здоровья и поведения животных.
знакомство с платформами для управления племенными базами данных
знать ERP-системы в животноводстве (Управление процессами)
ознакомиться с методами сокращения сроков выведения линий: высокопроизводительный геномный скрининг (High-Throughput Genotyping/Phenotyping), геномная селекция (Genomic Selection, GS), параллельные эксперименты и ускоренные циклы (Speed Breeding), маркерная селекция (MAS) и редактирование генома
рассчитывать экономическую эффективность селекции: расчет ROI (Return on Investment) - (прибыль от реализации нового сорта - затраты на селекцию), оценку стоимости генетического улучшения, индексную селекцию
анализирует работу по управление рисками
выполнить построение прогностической модели для оценки племенной ценности
выполнить анализ геномных данных с использованием ПО (Plink, R/Python).
знакомство с внедрением ИИ-систем управления стадом и блокчейна для племенного учета скота

Содержание учебной дисциплины

Модуль 1. Введение в цифровизацию АПК и основы селекции животных
Модуль 2. Генетические основы и современные биотехнологии
Модуль 3. Искусственный интеллект и анализ данных в селекции животных
Модуль 4. Цифровые инструменты управления стадом
Модуль 5. Управление селекционными проектами и экономика
Модуль 6. Практикум: кейсы и инновации (животные)

Элементы контроля

Презентации
Oral interview
Экзамен

Промежуточная аттестация

2026/2027 4th module
0.4 * Презентации + 0.3 * Презентации + 0.3 * Oral interview

Список литературы

Рекомендуемая основная литература

NGS: высокопроизводительное секвенирование - Ребриков Д. В., Коростин Д. О., Шубина Е. С., Ильинский В. В. - Издательство "Лаборатория знаний" - 978-5-93208-671-1 - 2024 - русский - https://e.lanbook.com/book/387620 - ЛАНЬ - 387620
Pelletier, S. J., & Cicchetti, F. (2015). Cellular and Molecular Mechanisms of Action of Transcranial Direct Current Stimulation: Evidence from In Vitro and In Vivo Models. Retrieved from http://search.ebscohost.com/login.aspx?direct=true&site=eds-live&db=edsbas&AN=edsbas.879C4B68
Автоматизация процессов управления технологическими объектами в производственных системах - Руднева Л. Ю. - МИРЭА - Российский технологический университет - 978-5-7339-2167-9 - 2024 - русский - https://e.lanbook.com/book/421043 - ЛАНЬ - 421043
Алгоритм применения ГИС в эпизоотологическом мониторинге лейкоза крупного рогатого скота в Ленинградской и Кемеровской областях - Просвирнин Г. С., Кузьмин В. А., Гулюкин М. И., Фогель Л. С., Козыренко О. В., Кротов Л. Н., Мизерный С. Б., Зубова Т. В., Смоловская О. В., Плешков В. А. - Санкт-Петербургский государственный университет ветеринарной медицины - - - 2019 - русский - https://e.lanbook.com/book/137593 - ЛАНЬ - 137593
Афанасьева, О. Г. Агропромышленный комплекс ПФО России: итоги, инвестиции и цифровизация : монография / О. Г. Афанасьева. — Москва : Русайнс, 2022. — 108 с. — ISBN 978-5-4365-9771-3. — URL: https://book.ru/book/944830 (дата обращения: 01.07.2026). — Текст : электронный.
Баламирзоев, А. Г. Технологии BigDatu анализ больших данных : учебно-методическое пособие / А. Г. Баламирзоев. — Махачкала : ДГПУ, 2024. — 98 с. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/442652 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.
Дарвин, Ч. Р. Происхождение видов путем естественного отбора / Ч. Р. Дарвин ; переводчик К. А. Тимирязев. — Москва : Издательство Юрайт, 2025. — 445 с. — (Антология мысли). — ISBN 978-5-534-06675-3. — Текст : электронный // Образовательная платформа Юрайт [сайт]. — URL: https://urait.ru/bcode/564768 (дата обращения: 02.07.2026).
Изменчивость и наследуемость белковомолочности у коров черно-пёстрой породы разных генераций и генотипов - Мкртчян Г. В., Бакай Ф. Р. - Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии им. К. И. Скрябина - 978-5-6048568-8-8 - 2022 - русский - https://e.lanbook.com/book/331376 - ЛАНЬ - 331376
Изменчивость и наследуемость белковомолочности у коров черно-пестрой породы разных генераций и генотипов - Мкртчян Г.В. - Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии им. К. И. Скрябина - - - 2013 - русский - https://e.lanbook.com/book/49962 - ЛАНЬ - 49962
Казаков Н.В. - Промышленное лесопользование. Цифровизация и автоматизация - 978-5-9729-1132-5 - Инфра-Инженерия - 2023 - https://znanium.ru/catalog/product/2098513 - 2098513 - ZNANIUM
Кобзаренко, Д. Н. Учебное пособие дисциплины «Анализ больших данных» для направления подготовки 38.03.05 «Бизнес-информатика», профиль «Электронный бизнес» : учебное пособие / Д. Н. Кобзаренко, А. Г. Мустафаев , составитель Д. Н. Кобзаренко. — Махачкала : ДГУНХ, 2019. — 107 с. — Текст : электронный // Лань : электронно-библиотечная система. — URL: https://e.lanbook.com/book/246542 (дата обращения: 00.00.0000). — Режим доступа: для авториз. пользователей.
Компьютерное зрение / пер. с англ. — 5-е изд., электрон. — (Лучший зарубежный учебник) - 978-5-93208-725-1 - Шапиро Л., Стокман Дж. - 2024 - Москва: Лаборатория знаний - https://ibooks.ru/products/396375 - 396375 - iBOOKS
Маркова Е., Конькова Л. И. - Развитие особей двух видов рода Iris L. в культуре in vitro - Удмуртский Государственный университет - 2010 - https://znanium.ru/catalog/product/495966 - 495966 - ZNANIUM
Машинное обучение и искусственный интеллект в медицине. Алгоритмы, приложения и перспективы - Золкин А. Л., Мунистер В. Д., Подолько П. М. - Издательство "Лань" - 978-5-507-53095-3 - 2025 - русский - https://e.lanbook.com/book/505459 - ЛАНЬ - 505459
Машинное обучение с использованием Python - - - Московский технический университет связи и информатики - - - 2025 - русский - https://e.lanbook.com/book/501209 - ЛАНЬ - 501209
Методы изучения иммунной системы животных - Ездакова И. Ю., Гулюкин А. М. - Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии им. К. И. Скрябина - 978-5-86341-477-5 - 2022 - русский - https://e.lanbook.com/book/271232 - ЛАНЬ - 271232
Орлова Е.В. - Исследования и разработки (R&D): анализ данных и экономическая эффективность - 978-5-16-018291-9 - ИНФРА-М - 2024 - https://znanium.ru/catalog/product/1959274 - 1959274 - ZNANIUM
Оценка жизнеспособности клеток in vitro - Пескова Н. Н., Балалаева И. В., Брилкина А. А., Шилягина Н. Ю., Масленникова А. В., Мысягин С. А. - Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского - - - 2020 - русский - https://e.lanbook.com/book/191652 - ЛАНЬ - 191652
Сацюк А.В. - Компьютерное зрение и нейронные сети. Практика - 978-5-9729-2706-7 - Инфра-Инженерия - 2025 - https://znanium.ru/catalog/product/2225332 - 2225332 - ZNANIUM
Спектральный анализ в биомедицине - - - Вологодский государственный университет - - - 2018 - русский - https://e.lanbook.com/book/291911 - ЛАНЬ - 291911
Управление рисками в агропромышленном комплексе региона - Китаёв Ю. А., Китаёва О. В., Сидоренко А. А. - Белгородский государственный аграрный университет имени В.Я. Горина - 978-5-6047966-9-6 - 2022 - русский - https://e.lanbook.com/book/332027 - ЛАНЬ - 332027
Управление рисками в сельском хозяйстве : монография / О. А. Моторин, М. И. Горбачев, Г. А. Суворов [и др.]. — Москва : Русайнс, 2019. — 226 с. — ISBN 978-5-4365-3990-4. — URL: https://book.ru/book/934498 (дата обращения: 01.07.2026). — Текст : электронный.
Функциональная анатомия центральной нервной системы : Учеб. пособие, Гайворонский И.В., Гайворонский, А.И., 2006
Цифровизация агропромышленного комплекса: сборник научных статей I Международной научно-практической конференции. В 2-х т. Т. I - - - Тамбовский государственный технический университет - 978-5-8265-1942-4 - 2018 - русский - https://e.lanbook.com/book/319892 - ЛАНЬ - 319892
Цифровизация агропромышленного комплекса: сборник научных статей I Международной научно-практической конференции. В 2-х т. Т. II - - - Тамбовский государственный технический университет - 978-5-8265-1943-1 - 2018 - русский - https://e.lanbook.com/book/319895 - ЛАНЬ - 319895
Эволюционные нейросети на языке Python - Я.Омельяненко - ДМК Пресс - 9785970608548 - 2020 - русский - https://hse.alpinadigital.ru/document/21622 - Alpina - 21622
Экономика рыбного хозяйства. Цифровизация управления : учебник для вузов / под общей редакцией Л. И. Сергеева, А. Г. Мнацаканяна. — Москва : Издательство Юрайт, 2025. — 318 с. — (Высшее образование). — ISBN 978-5-534-14841-1. — Текст : электронный // Образовательная платформа Юрайт [сайт]. — URL: https://urait.ru/bcode/568147 (дата обращения: 02.07.2026).
Экономическая эффективность комплексного использования ресурсов леса. Практикум - Грязькин А. В. - Издательство "Лань" - 978-5-507-44494-6 - 2022 - русский - https://e.lanbook.com/book/260663 - ЛАНЬ - 260663
Экономическая эффективность ликвидации накопленного экологического ущерба и восстановления деградированных земель. Монография - Проспект - Под ред. Носова С.И. - 978-5-9908885-6-2 - 2016 - http://ebs.prospekt.org/book/33139 - PROSPECT - 33139

Авторы

Новикова Любовь Михайловна

Программа дисциплины