• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта
2026/2027

Генетические технологии в персонализированной медицине

ID 1216571

Статус: Маго-лего
Охват аудитории: для всех кампусов НИУ ВШЭ
Язык: русский
Кредиты: 3
Контактные часы: 40

Программа дисциплины

Аннотация

Дисциплина преподается с целью изучения современных биоинформатических методов обработки, анализа и интерпретации генетических данных для внедрения персонализированных стратегий профилактики и лечения.
Цель освоения дисциплины

Цель освоения дисциплины

  • Сформировать у обучающихся теоретические знания и практические навыки проектирования, проведения и интерпретации геномных ассоциативных исследований, включая анализ данных исследований типа «случай–контроль», контроль систематических ошибок и популяционной стратификации, а также интеграцию результатов GWAS с функциональными и клиническими геномными данными.
Планируемые результаты обучения

Планируемые результаты обучения

  • Знать принципы построения и анализа исследований типа «случай–контроль» и методы эпидемиологической оценки ассоциаций
  • Знать основные этапы и методы GWAS, включая контроль качества данных, статистическое тестирование и коррекцию множественных сравнений
  • Знать методы фазирования и импьютинга генетических данных и их роль в повышении мощности анализа
  • Знать расширенные и модифицированные подходы GWAS, включая смешанные линейные модели и метаанализ
  • Знать методы оценки наследуемости, LD-score регрессии и анализа генетических корреляций
  • Знать подходы fine-mapping и менделевской рандомизации для выявления каузальных эффектов
  • Знать принципы построения полигенных шкал риска и применения методов машинного обучения
  • Знать основы фармакогенетики и клинической интерпретации генетических вариантов
  • Приобретение и закрепление знаний в области современных генетических технологий в персонализированной медицине, усвоенных в рамках занятий
Содержание учебной дисциплины

Содержание учебной дисциплины

  • Исследования типа «случай–контроль» и полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)
  • Фазирование и импьютинг генетических данных
  • Модификации GWAS
  • LD-score регрессия, оценки наследуемости, генетические корреляции
  • Fine-mapping и менделевская рандомизация
  • Полигенные шкалы риска (PRS)
  • Модели машинного обучения для прогнозирования риска
  • Фармакогенетика
  • Клиническая генетика, онкогенетика и жидкая биопсия
  • CNV-анализ
Элементы контроля

Элементы контроля

  • неблокирующий Квизы
    Квиз в начале каждого занятия
  • неблокирующий Экзамен
  • неблокирующий Домашние задания
Промежуточная аттестация

Промежуточная аттестация

  • 2026/2027 3rd module
    0.4 * Экзамен + 0.2 * Квизы + 0.4 * Домашние задания
Список литературы

Список литературы

Рекомендуемая основная литература

  • Биоинформатика с Python: книга рецептов : современные библиотеки и приложения Python для решения реальных задач вычислительной биологии, Антао, Т., 2023

Авторы

  • Ракитько Александр Сергеевич